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海洋災害預警提前至30天 青島這臺"超算"威力不小

2018-02-22 09:39   來源: 半島網-半島客戶端 手機看新聞 半島網 半島都市報

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?  記者日前從青島海洋科學與技術國家實驗室獲悉,自2016年12月投入應用一年來,我國海洋科研領域運算速度最快的高性能科學計算與系統仿真平臺——P級“超級計算機”,在海洋環境預報和海洋藥物篩選領域發揮了重要作用:海洋預報分辨率達到10公里級,預報時效可延伸至30天;初步完成了170個抗腫瘤藥物靶點與1800萬生物小分子的篩選,并實現每兩天完成一個靶點與1800萬生物小分子的對接。

  借助“超級計算機”的超強計算能力,海洋國家實驗室在全球率先實現了對西太平洋、印度洋和中國南海“兩洋一海”區域的海洋氣象環境預報,預報時間從常規一周內,擴展到可預警30天內的災害性海洋狀況,預報的分辨率也從以往的35公里精進到10公里以內,比國際上先進的海洋預報還要精確數十倍之多。

  更精細、更準確、更長期的海洋預報是海洋生命線的可靠保障,未來隨著每秒運算速度達百億億次的E級超算落戶青島,將使該預報系統的分辨能力再提升10倍,突破500米大關,海洋學家們可以捕捉預測更精準細微的海洋現象。

  據海洋國家實驗室超算平臺主任魏志強介紹,除了海洋預報,P級超算已成功應用于海洋藥物篩選。魏志強告訴記者,人類19000個基因可以編碼出20萬個蛋白質,其中可以與藥物結合的“靶點蛋白”有893個。截至去年年底,超算平臺已經初步完成了對893個藥物靶蛋白中的170個抗腫瘤靶點的虛擬篩選。

  這個計算量到底有多大?“如果沒有超算平臺這幾乎是不可能完成的任務,在普通計算平臺上,要找到這170個抗腫瘤藥物靶點至少也要耗時幾十年。”魏志強說,而海洋國家實驗室的超級計算機只用了大約半年時間。

  據了解,海洋國家實驗室的遠期目標是將893個藥物靶蛋白與4000萬個可以用于制藥的生物小分子進行對接。這項工作的計算量在目前的超算平臺大約要耗時22年,如果將來E級超算建成,可以在3至4個月內完成。

  目前,海洋國家實驗室海洋創新藥物篩選與評價平臺、高性能科學計算與系統仿真平臺、青島海洋生物醫藥研究院、中國海洋大學、江蘇理工大學已經聯合提出了“智能超算藥物組學計劃”,藥物計算系統軟件已在超算平臺平穩運行,能夠實現兩天內對1800萬分子的篩選。同時,項目組還建立了含有近萬個分子的海洋化合物庫。(半島全媒體記者)

   [編輯: 劉曉明]

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