?　　半島全媒體記者　徐杰　報(bào)道

　　半島都市報(bào)2月22日訊　22日,記者從青島海洋科學(xué)與技術(shù)國家實(shí)驗(yàn)室獲悉,自2016年12月投入應(yīng)用一年來,我國海洋科研領(lǐng)域運(yùn)算速度最快的高性能科學(xué)計(jì)算與系統(tǒng)仿真平臺(tái)——P級“超級計(jì)算機(jī)”,在海洋環(huán)境預(yù)報(bào)和海洋藥物篩選領(lǐng)域發(fā)揮了重要作用。其中,海洋預(yù)報(bào)分辨率已達(dá)到10公里級,預(yù)報(bào)時(shí)效可延伸至30天；并初步完成了170個(gè)抗腫瘤藥物靶點(diǎn)與1800萬生物小分子的篩選,實(shí)現(xiàn)了每兩天完成一個(gè)靶點(diǎn)與1800萬生物小分子的對接。

　　據(jù)介紹,借助“超級計(jì)算機(jī)”的超強(qiáng)計(jì)算能力,海洋國家實(shí)驗(yàn)室在全球率先實(shí)現(xiàn)了對西太平洋、印度洋和中國南海“兩洋一海”區(qū)域的海洋氣象環(huán)境預(yù)報(bào),預(yù)報(bào)時(shí)間從常規(guī)一周內(nèi),擴(kuò)展到可預(yù)警30天內(nèi)的災(zāi)害性海洋狀況,預(yù)報(bào)的分辨率也從以往的35公里精進(jìn)到10公里以內(nèi),比國際上先進(jìn)的海洋預(yù)報(bào)還要精確數(shù)十倍。

　　除了海洋預(yù)報(bào),如今P級超算已成功應(yīng)用于海洋藥物篩選。海洋國家實(shí)驗(yàn)室超算平臺(tái)工作人員介紹,人類19000個(gè)基因可以編碼出20萬個(gè)蛋白質(zhì),其中可以與藥物結(jié)合的“靶點(diǎn)蛋白”有893個(gè)。截至2017年底,超算平臺(tái)已經(jīng)初步完成了對893個(gè)藥物靶蛋白中的170個(gè)抗腫瘤靶點(diǎn)的虛擬篩選。這個(gè)計(jì)算量到底有多大?工作人員舉例說,在普通計(jì)算平臺(tái)上要找到這170個(gè)抗腫瘤藥物靶點(diǎn)至少也要耗時(shí)幾十年,而海洋國家實(shí)驗(yàn)室的超級計(jì)算機(jī)只用了大約半年時(shí)間。

　　據(jù)了解,海洋國家實(shí)驗(yàn)室的遠(yuǎn)期目標(biāo)是將893個(gè)藥物靶蛋白與4000萬個(gè)可以用于制藥的生物小分子進(jìn)行對接。這項(xiàng)工作的計(jì)算量在目前的超算平臺(tái)大約要耗時(shí)22年,如果將來E級超算建成,可以在3至4個(gè)月內(nèi)完成。目前,海洋國家實(shí)驗(yàn)室海洋創(chuàng)新藥物篩選與評價(jià)平臺(tái)、高性能科學(xué)計(jì)算與系統(tǒng)仿真平臺(tái)、青島海洋生物醫(yī)藥研究院、中國海洋大學(xué)、江蘇理工大學(xué)已經(jīng)聯(lián)合提出了“智能超算藥物組學(xué)計(jì)劃”,藥物計(jì)算系統(tǒng)軟件已在超算平臺(tái)平穩(wěn)運(yùn)行,能夠?qū)崿F(xiàn)兩天內(nèi)對1800萬個(gè)分子的篩選。同時(shí),項(xiàng)目組還建立了含有近萬個(gè)分子的海洋化合物庫。

　　 [編輯: 張珍珍]